Šimůnková byla zmocněnkyní pro lidská práva za vlády Petra Nečase (ODS), řídila vládní sekci pro lidská práva. Pracovala také v Nadaci Naše dítě a v Českém helsinském výboru.
Rozdílný pohled na pojetí lidských práv - to byl podle Moniky Šimůnkové důvod pro její odvolání z pozice ředitelky vládní sekce pro lidská práva. Šimůnková poté rezignovala i na funkci vládní zmocněnkyně.
Spor o odvolání šéfky vládní sekce pro lidská práva Moniky Šimůnkové dostal další rozměr. Šimůnková tvrdí, že se ministr vnitra v demisi Martin Pecina snažil přesunout agendu lidských práv pod svůj resort. Pecina to odmítá.
Vládní zmocněnkyně pro lidská práva Monika Šimůnková odmítla kritiku zprávy o národnostních menšinách. Tu nejdříve vláda schválila, ale po týdnu ji smetla ze stolu kvůli kontroverzní pasáži o ruských kozácích v Česku. Materiál varoval před rozpínáním se této skupiny v České republice.
Vláda dnes přijala strategii boje proti sociálnímu vyloučení, kterou předložila vládní zmocněnkyně pro lidská práva Monika Šimůnková. Na přípravě se podílela také Agentura pro sociální začleňování. Strategie byla výsledkem jednání s jednotlivými ministerstvy a vztahuje se k letům 2011 až 2015.
Vládní zmocněnkyně pro lidská práva Monika Šimůnková dnes předkládá ministrům strategii pro sociálně vyloučené lokality. Nabízí desítky kroků v oblasti bydlení, sociálních služeb, zaměstnanosti, vzdělávání, ale i potíráni kriminality.